يتميز قسم الأطفال بالمستشفى التخصصي بوجود كادر طبي وتمريض مؤهل لعلاج جميع أنواع أمراض الأطفال ومنها: أمراض الغدد الصماء، وضعف النمو، وقصر القامة، وسكري الدم، حيث يتوفر فيه الإمكانيات اللازمة من فحوصات طبية ومختبرية وصور اشعاعية لتشخيص وعلاج هذه الحالات تحت إشراف استشاري غدد صماء وسكري أطفال، بالإضافة إلى وجود أحدث الطرق للعلاج ومواكبة كل ما هو جديد في الفحص والعلاج، كما ويتوفر لدينا مثقف سكري قادر على متابعة أطفال السكري في منازلهم وذلك لتيسير المرض على الأهل، حيث يقوم بتدريبهم على أحدث الطرق العلاجية للسيطرة على هذا المرض، إضافة إلى وجود استشاري تغذية لتقديم النصح لهم.
يتوفر في المستشفى التخصصي علاج جميع حالات قصر القامة، وضعف النمو وذلك عن طريق عمل فحص لتحفيز هرمون النمو بالتالي القدرة على النمو بالطريقة الصحيحة، وأيضا علاج جميع أنواع النقص أو الزيادة في وظائف الغدد الصماء وعلاج البلوغ المبكر مما له من تأثير نفسي على الأطفال عدا عن التأثير الطبي.
وأخيراً وليس آخراً يتوفر لدينا أحدث الطرق لعلاج سكري الأطفال وذلك عن طريق وضع مضخة الانسولين تقوم بتيسير المرض على المريض من إعطاء الأنسولين وحساب سكري الدم بأسهل الطرق وبدون أي آلام.