يفخر المستشفى التخصصي بكونه مركزا متكاملا للجراحة بكافة تخصصاتها ومن أجل تأمين حاجة المرضى والفرق الجراحية للعدد الجراحية والأدوات بمختلف أشكالها وأنواعها وأحجامها قام المستشفى بإنشاء إحدى أكبر وحدات التعقيم المركزي في المستشفيات الخاصة في الأردن وهي مجهزة حسب أحدث التطورات في علم التعقيم لكي تناسب باقي التطورات في المستشفى مثل تطوير قسم العمليات والتنظير والقسطرة وغيرها لتواكب تطورات العلوم الحديثة.
من أهم مميزات هذه الدائرة أنها مكونه من ثلاثة مناطق معزولة تماماً عن بعضها وعن باقي المستشفى والمناطق هي:
وهذه المناطق معزولة عن بعضها تماماً حتى في مجاري الهواء حيث أن الهواء ذا ثلاثة أنواع في الضغط الجوي ليكون سالباً في الأولى وموجباً في الثانية وموجباً مضاعفاً في الثالثة لكي يتم تغيير الكتلة الهوائية داخل القسم بالكامل (10) مرات في الساعة الواحدة.
ولقد تم تجهيز الدائرة بأحدث الأجهزة مثل جهاز البلازما للتعقيم السريع الآمن وكذلك باستخدام جهاز آخر للبخار يعمل بتقنية حديثة ومتطورة ولا يحتاج إلى استهلاك ماء مما يوفر في الماء وهذا بدوره يعتبر فائدة قومية ووطنية.
كماأنه يتم ربط كافة الأجهزة ضمن برنامج كمبيوتر لكي يتم إدارة هذا القسم بواسطة الكمبيوتر وهذا الأول من نوعه في الأردن والمناطق المجاورة.
وقد تم التعاقد مع شركات عالمية لتصنيع العدد الجراحية ( مثل شركة اسكولاب الألمانية وغيرها) ليكون هذه الدائرة هي المركز التدريبي و سوف يتم منح شهادات معترف بها دولياً و محلياً في مجال تعقيم العدد الجراحة وبذلك تكون دائرة التعقيم هيالدائرة التعليمية الوحيدة في الأردن. هذا و حرصا على حماية البيئة من خطر النفايات الطبية فقد تم وضع مسؤولية وحدة معالجة النفايات الطبية الخطرة مع دائرة التعقيم للأهمية و الإتقان، و قد تم توسيع الوحدة لمضاعفة الإنتاج للمساهمة في حل مشكلة النفايات الطبية في بعض المستشفيات الأخرى للمساهمة في الحل الجذري بالكفاءة العالية والمطابقة مع أعلى المواصفات والمقاييس العالمية.